Endodontik olarak enfekte süt ve kalıcı dişlerin mikrobiyotası

[ X ]

Tarih

2022

Dergi Başlığı

Dergi ISSN

Cilt Başlığı

Yayıncı

Erişim Hakkı

info:eu-repo/semantics/openAccess

Özet

Karışık dişlenme döneminde ağızda bulunan daimi ve süt dişlerin endodontik mikrobiotasındaki çeşitliliği 16S rRNA gen sekanslaması ve QIIME 2 analizi kullanarak incelemekti. Spontan ağrı şikayeti ile diş tedavisi olmak için başvuran 30 çocuk hastanın endodontik olarak enfekte süt ve daimi molar dişlerinin pulpasından paper point kullanılarak mikrobiyal örnekler alındı. Örneklerden bakteri DNA’sı ekstraksiyonu yapıldı. 16S rRNA geninin hiperdeğişken V3-V4 bölgesinin incelenmesine dayalı olarak QIIME 2 analizine tabi tutuldu. Alfa ve beta çeşitlilik analizi için filogenetik ağaç oluşturuldu. Gruplar arasında bakteri bolluğu Wilcoxon testi kullanılarak incelenmiştir. Gözlemlenen operasyonel taksonomik birimler (OTU'lar), Shannon indeksi, Faith'in filogenetik çeşitliliği ve Eşitlik; alfa çeşitlilik metrikleri olarak hesaplandı. Ağırlıklı UniFrac, ağırlıksız UniFrac, Bray Curtis, Jaccard, UniFrac mesafe tabanlı metrik olmayan çok boyutlu ölçekleme ve temel bileşen analizi (PcoA); beta çeşitlilik metrikleri olarak hesaplandı. İstatistiksel analiz R yazılımı kullanılarak yapıldı. Çalışmamızdaki endodontik olarak enfekte daimi ve süt dişlerin endodontik mikrobiotasında 14 filum, 89 familya ve 236 cins belirlendi. Firmicutes, hem süt hem de daimi diş kök kanallarında en sık saptanan filumdu. Bacteroides ve Proteobacteria süt dişlerinde, Actinobacteria ve Verrucomicrobia ise daimi dişlerde daha yaygındı. Süt ve daimi diş kanallarında tür zenginliği ve eşitliği açısından istatistiksel olarak anlamlı bir fark yoktu (p>0.05). Ancak filogenetik bir farklılık bulundu. Anaeroblar ağırlıklı olarak hem süt hem de daimi dişlerde bol miktarda idi. Ancak süt dişlerinde daimi dişlere göre anaerob oranının daha yüksek, aerob veya fakültatif anaerob oranının ise daha düşük olduğu görüldü. Bu çalışma, endodontik olarak enfekte olmuş süt ve daimi dişlerde mikrobiyota bileşiminin kapsamlı bir değerlendirmesini sağlayarak, kök kanal enfeksiyonlarının kökeni hakkında daha derin bir fikir vermektedir. Enfekte süt dişlerinin pulpasında kalıcı dişlere göre daha fazla sayıda operasyonel taksonomik birim bulunmuştur. Endodontik olarak enfekte süt ve daimi dişlerin mikrobiyal zenginliği ve eşitliği oldukça benzer bulunmasına rağmen, bazı filogenetik farklılıklar vardı.

Açıklama

Anahtar Kelimeler

Diş hekimliği

Kaynak

7th International Zeugma Conference on Scientific Research

WoS Q Değeri

Scopus Q Değeri

Cilt

Sayı

Künye